全局性基因表达分析揭示双峰驼独特的组织特征
近日,中国农业科学院北京畜牧兽医研究所畜禽种质资源保护与利用科技创新团队联合内蒙古阿拉善盟骆驼科学研究所首次获得了阿拉善双峰驼主要组织的转录组图谱,揭示了各组织的基因表达模式和特征,挖掘了参与脂肪代谢、水平衡、免疫和消化等四个模块的核心基因,以及一批可能影响双峰驼沙漠适应性的关键基因。相关研究成果发表在SCI《农业(Agriculture)》上。
研究人员以内蒙古阿拉善双峰驼为实验材料,分别采集胚胎期和成年期双峰驼的9个组织(心肌、肝、脾、肺、肾、小肠、瘤胃、驼峰和腿肌)进行了全面的转录组分析。基因表达和功能分析表明中约有50%的基因在所有组织中广泛表达,三分之一基因为组织升高基因,这些基因在相应组织的生物功能相关通路中富集。加权基因共表达网络分析鉴定了脂肪代谢、水平衡、免疫和消化四个模块和核心基因,包括APOA1、TMEM174、CXCL12和MYL9。对胚胎期和成年期双峰驼组织进行差异表达基因的分析,结果表明成年双峰驼下调基因主要富集于组织发育,而上调基因主要富集于生物功能。驼峰中的差异表达基因在免疫相关途径中富集,提示该组织参与免疫。此研究表明骆驼作为适应沙漠环境的哺乳动物,是挖掘环境胁迫与基因表达模式的理想模型,研究首次获得了双峰驼主要组织的转录组图谱,挖掘了可能参与双峰驼适应沙漠环境的重要基因。
原文链接:http://nmt.nmg.gov.cn/xw/msdt/als/202209/t20220906_2126973.html
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